第一百零五章 生命禁區(qū)
果然,一切都充滿“驚喜”。
邁過那道加大加寬的黃色屏蔽門后,映入眼簾的是四個紅色大橫幅,上面寫著:
頭上懸著三把劍:
如何逆轉(zhuǎn)非編碼區(qū)基因變異進(jìn)程?
腺病毒究竟如何通過影響非編碼RNA影響植物?
倒計時2555天。
盧赫掐著指頭算了算,2555天差不多是7年。
不是還有13年嗎,怎么還縮水了呢?這可不是什么好消息。
滿腹狐疑地經(jīng)過那套熟悉的復(fù)雜流程,他來到了實驗室內(nèi),明亮的燈光刺得他睜不開眼睛。
這些鑲嵌在吊頂上的巨大燈管,散發(fā)著一種奇異的色彩。他很久沒見到過如此通透的白色了。
適應(yīng)了光線之后,他發(fā)現(xiàn)在一排空蕩蕩的生物安全柜前站著一個熟悉而陌生的身影,正抬頭直視著頭頂?shù)臒艄?,看得很入神?p> 他悄悄走過去,繞到對方側(cè)面,果然是一張熟悉的臉。
“你又挺過來了?可喜可賀啊?!彼滩蛔≌{(diào)侃道。即便在知道事情原委之后,他早已對曾經(jīng)把他給折騰不輕的事情釋然了,但面對眼前的枯槁小老頭,還是沒忍住。
對方?jīng)]有回應(yīng)他,依然抬頭望著燈,自顧自地說:“看到這些純白色的燈了嗎?多么純凈的顏色?!?p> “日光燈誰沒見過?汞蒸氣產(chǎn)生紫外光,紫外光轟擊熒光粉后的二級光子,就是純凈的白光。好看舒服但是費電,奢侈!”盧赫忍不住批判。
對方搖了搖頭,“這可不是日光燈,而是節(jié)能LED。藍(lán)色自發(fā)光材料的催化過程被攻克了,全光譜LED已經(jīng)開始量產(chǎn)。即便維持能源現(xiàn)狀,以后所有人也都能擁有燈光自由?!?p> 盧赫不以為然地點了點頭。他對這些并不感冒,心里滿滿都是對7年倒計時的疑惑,“門口的標(biāo)語看到了吧,倒計時只有7年,為什么?”
對方把目光投在盧赫臉上,緩緩開口:“因為我從最后一次被編輯,到第一次發(fā)病,期間間隔了7年多?!?p> 盧赫愣了一下,“我們的基因相似度大概還剩99.6%,你的現(xiàn)在是多少?”
“時間太久遠(yuǎn),我無法考究到我的原始基因組,我目前的基因組和時間間隔最久的一次,相似度是99.2%?!?p> “呦呵,那海總您要保重啊,再過幾個月,你和最初的你說不定就生殖隔離了!”
對方的臉上飄過一絲無奈,“我正好要找你,我們正在建立數(shù)據(jù)集,需要我盡可能多的基因組數(shù)據(jù)。2年前你跑到我公司揪下來的我的頭發(fā),還有沒有?”
盧赫轉(zhuǎn)了轉(zhuǎn)眼珠,“沒了,不過我可能還有測序結(jié)果,在我家里放著?!?p> “放哪里了,我讓人去取一下?!睂Ψ秸Z氣驚喜。
“沒必要?!北R赫回憶起往事,“我當(dāng)初從你頭發(fā)里提了三組基因,分別寄給三個公司測序,其中就有你們公司。你調(diào)下數(shù)據(jù)就行?!?p> “找過了,沒有??赡艽笸k姷臅r候,損失了?!?p> 盧赫無奈道:“我能先問下你們目前是什么思路嗎?你要搞機(jī)器學(xué)習(xí)?那種不可解釋的黑箱,有用嗎?”
對方點頭認(rèn)可,“沒錯,我們就是要做機(jī)器學(xué)習(xí),而且是具備可解釋性的小樣本機(jī)器學(xué)習(xí)。至于你說的黑箱,就算有些方法是黑箱,但好用就行了。
你們之前用的CRISPR脫靶分析軟件,其實就用了這種技術(shù)。那是巨硬亞洲研究院前幾年的成果。
他們建立了一個大型的數(shù)據(jù)集,記錄了與給定的向?qū)NA有一項核苷酸不匹配的所有可能的標(biāo)靶區(qū)域里發(fā)生的脫靶活動。
然后把數(shù)據(jù)喂給了一個兩個隱藏層的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),訓(xùn)練出了一個可以輸出所有潛在脫靶位點的模型。這是一個生成模型,可以得到每個脫靶位點的概率,據(jù)此計算脫靶評分?!?p> “太普通了,這只是實現(xiàn)了一個二線工具,還有沒有更驚艷的?”盧赫追問。
“有。
非同源末端連接機(jī)制還記得吧?剪刀剪完基因序列后,不管三七二十一直接把斷裂的基因給粘起來。
這種方式并不常用,一般都是用同源模板修復(fù)。一方面是剪的時候可能剪了不止一個地方,粘的時候卻可能只粘了其中一個。另一方面是細(xì)胞不樂意了直接就不粘了。
但有團(tuán)隊利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法準(zhǔn)確地預(yù)測到了細(xì)胞容易修復(fù)的基因位點,并用CRISPR和非同源末端連接治了病。
為了探索具有代表性的人類基因組序列的修復(fù)產(chǎn)物,他們設(shè)計了一千多個目標(biāo)位點,特征是向?qū)NA和靶標(biāo)基因,標(biāo)簽是非同源末端連接最終起了修復(fù)作用位點。
數(shù)據(jù)喂給了一個看起來結(jié)構(gòu)很復(fù)雜的模型,訓(xùn)練結(jié)果很是喜人,模型對11%的向?qū)NA的修復(fù)位點的預(yù)測準(zhǔn)確率在50%以上。
意味著這些向?qū)NA和相應(yīng)靶標(biāo)基因所對應(yīng)的疾病,可以用這種方式來治療。
最終他們治愈了赫曼斯基-普德拉克綜合征,一種能凝血不足和白化病的遺傳病。體外測試的修復(fù)準(zhǔn)確率高達(dá)94%。
這個夠驚艷嗎?”
盧赫連連點頭,“夠。這個思路不錯,是不是可以用在你身上,特征是某時間點的基因組,標(biāo)簽是未來的變異位點,提前預(yù)測變異,在發(fā)病前做修復(fù)?”
“沒錯?!睂Ψ娇隙ǖ馈?p> “可是這種方式,用在你一個人身上好說,其他人呢?萬一我們未來都要跟你一樣,總不能每個人都建一個模型吧?”
“也不是不可以。不過還是希望未來有別的辦法。這個思路已經(jīng)被提上日程了,底下四層全是測序中心的地盤?!?p> 盧赫露出了難以置信的表情,繼而又滿懷期待地追問,“也不對啊,我記得我當(dāng)初給你測序的時候,你突變的位點很多都在編碼區(qū)的。也許我們和你不一樣?!?p> “沒太大差別,前期確實大都在編碼區(qū),但后來也往非編碼區(qū)發(fā)展了。
非編碼區(qū)早就不是最初認(rèn)知中的“垃圾”區(qū),隨著研究的推進(jìn),它的重要作用也被逐漸揭示。之所以我年紀(jì)越大越嚴(yán)重,很可能就是因為后期突變在了非編碼區(qū)。
很顯然,那里不是可以隨意落筆的空白畫布,而是地獄的入口,是禁區(qū)?!?p> 對方說完,嘆了一口氣,便又開始仰頭看燈,“我的測序結(jié)果放在你家哪里?得盡快派人去取,樣本本來就不多,數(shù)據(jù)很珍貴?!?p> “不用找別人,我自己去吧,我也不確定在不在,在哪里?!?p> 不一會兒,他又從鄭K手里弄到了車鑰匙,還收到了一連串的囑咐:
四通八達(dá)的隧道只限本市,去外市有一段路要走地上。
除了第110號掩體以外,其余的都還沒有下移動通訊網(wǎng)絡(luò),沒法定位,需要熟記地圖。
這兩天天氣不錯,風(fēng)不大,能見度好,路上也沒人。但別開太快,路面有沙子,滑。
出去之前,找后勤給車上加點配重。