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四進(jìn)制造物主

第二十二章 鋅指帝國(guó)

四進(jìn)制造物主 非奇異矩陣 4331 2022-11-12 18:00:00

  3樓的窗口始終亮著暖黃色的燈,一亮就是三天。

  第四天中午,菜菜在刺耳的門(mén)鈴聲中慌亂地跑到院門(mén)口簽收了快遞,迎著快遞員嗔怪的目光連說(shuō)了好幾次不好意思。冰冷的雨滴連連砸在她的后脖頸,激得她不停哆嗦。

  在返回細(xì)胞間的路上,她默默地抬頭望了一下那熟悉的窗口,輕輕嘆了口氣。

  那個(gè)老宅男的心情,一定和這天氣一樣烏云密布吧。繼天使死亡后,打擊接踵而來(lái)。皮卡丘第一枚蛋停止發(fā)育,大眼仔第三枚蛋也停止發(fā)育。他壓了那么多的注,卻連一把也沒(méi)贏。

  她在緩沖室門(mén)口拆開(kāi)快遞,抱著試劑盒快步走進(jìn)細(xì)胞間。雖然金哥二世依舊沒(méi)有編輯成功,但這仍是目前最穩(wěn)妥的一注。她得再加把勁,好把那個(gè)老宅男從陰霾中拉出來(lái)。

  而此時(shí),菜菜口中的老宅男正窩在電腦前,桌上、地上、床上到處散落著密密麻麻滿(mǎn)是英文字的紙,桌角的打印機(jī)仍在嗡嗡作響。

  不一會(huì)兒,又有20張紙被吐了出來(lái)。盧赫給訂書(shū)機(jī)換上新的書(shū)釘,咔嚓一下釘在那打紙的左上角。

  一連幾天,他都像嫩蠶啃桑葉一樣,不眠不休地啃著他能找到的所有有關(guān)CRISPR和蜥蜴基因組的文獻(xiàn),卻始終一無(wú)所獲。

  很快,他啃完了手里的這篇,咻地一下把它擲到了地上。又重新拿起桌角皺巴巴的、甚至已經(jīng)被摸黑了的那疊紙。

  那是幾年前首次使用CRISPR系統(tǒng)敲除棕色變色蜥蜴酪氨酸酶基因的文獻(xiàn),以及該團(tuán)隊(duì)公開(kāi)的部分測(cè)序的變色蜥蜴的基因組。

  “沒(méi)錯(cuò)啊,真的沒(méi)錯(cuò)啊,001上測(cè)到了完全一致的片斷。雖然敲的時(shí)候由于PAM序列的限制,少敲了6個(gè)堿基對(duì)。但沒(méi)有任何證據(jù)表明,這遺留下的小片段是一種關(guān)鍵的表達(dá)。”盧赫把紙蓋在臉上抓狂,“人家的白色小變色龍直到現(xiàn)在都還活著,為什么001的子一代那么快就得癌了呢?”

  “為什么?。俊?p>  他仰天長(zhǎng)嘆,捏著眉頭細(xì)細(xì)思索,頭腦中冒出了一個(gè)生物科研狗專(zhuān)屬的大膽想法:

  把這6個(gè)堿基對(duì)敲入其它守宮,如果子代患癌,就可以證明確實(shí)是它們的問(wèn)題。

  可隨后他又苦笑著搖頭,“開(kāi)什么玩笑,你下得去手嗎?”

  他確實(shí)下不去手。一直以來(lái),他都是在體外做電泳檢測(cè),測(cè)到足夠高的剪切效率之后,才會(huì)考慮導(dǎo)入。相比于批量導(dǎo)入隨機(jī)冒碰的方式,這種方法很慢、很低效。但作為一個(gè)10年爬玩,他不接受自己的寶貝們成為小白鼠。

  退一步講,就算能確認(rèn)那些多余的堿基是癌癥驅(qū)動(dòng)基因,又有什么用呢?CRISPR系統(tǒng)里的PAM限制,就像是自然界甩給那些試圖成為造物主的人一條鎖鏈,讓他們只能戴著鐐銬跳舞。

  想到這里,他不由打了個(gè)哈欠,吐出一口濁氣,渡步到窗子前,對(duì)著滂沱的大雨發(fā)呆。

  難道,只能用鋅指了嗎?

  許久之后,他像是下了很大的決心,把窗子打開(kāi),抻著脖子嗓音嘶啞地喊了一句:“菜長(zhǎng)蟲(chóng)——”

  正在一樓的喂龜?shù)牟瞬耍鋭?dòng)了動(dòng)。她狐疑地放下抱在懷里的龜糧罐,悄聲走到門(mén)口探頭。

  她見(jiàn)院子里沒(méi)什么動(dòng)靜,便又不甘心地打傘出去。許久未打掃的滿(mǎn)地枯葉已被雨水浸濕,黏在腳上滑滑的,讓她險(xiǎn)些摔個(gè)跟頭。

  “你干嘛呢這么慢?”

  熟悉的聲音在頭頂響起,菜菜驚喜地抬頭,傘從肩上滑落,雨水直直打在額頭上,但她并不覺(jué)得冷。

  “呀!盧哥!你活過(guò)來(lái)了!”

  盧赫遞給菜菜一個(gè)眼刀:“你這是盼著我死好繼承我的螞蟻花唄嗎?交給你一個(gè)任務(wù),去聯(lián)系幾個(gè)能組鋅指的廠家,詢(xún)?cè)儍r(jià)?!?p>  “Yes Sir!”

  恍然間,生活已回歸正軌。菜菜坐在細(xì)胞間的電腦前,搖頭晃腦地著哼歌,“打開(kāi)受傷的翅膀,來(lái)為自己戴上,掉下的皇冠,無(wú)論世界有多瘋狂。。?!?p>  可沒(méi)幾句,她便噤了聲。

  她細(xì)細(xì)地檢索鋅指技術(shù)相關(guān)的信息,可出來(lái)的結(jié)果不是科普文章,就是老掉牙的學(xué)術(shù)論文。哪怕她在關(guān)鍵字中加上“公司”兩字,某度檢索頁(yè)面的前幾條卻也清清白白干干凈凈地沒(méi)有任何廣告。

  “咦?怎么沒(méi)有呀?”

  不光國(guó)內(nèi)沒(méi)有,國(guó)外也沒(méi)有。高級(jí)檢索搜出來(lái)的結(jié)果里,全部都是圣加蒙公司的新聞。圣加蒙就是那個(gè)在20多年前就壟斷掉鋅指相關(guān)技術(shù),專(zhuān)門(mén)做基因治療的老牌商業(yè)帝國(guó)。

  可圣加蒙本身,現(xiàn)在也只接收基因治療臨床合作,不出售鋅指組裝平臺(tái)和代組裝服務(wù)。

  于是菜菜叫來(lái)了盧赫。

  盧赫剛剛沐浴完畢,洗掉了積攢了幾天的濁氣。他應(yīng)聲出現(xiàn)在細(xì)胞間里,頭上還濕噠噠地裹著浴巾,被冷風(fēng)吹得直哆嗦。

  “怎么可能?圣加蒙的鋅指專(zhuān)利早在兩年前就過(guò)期了,怎么可能會(huì)沒(méi)有仿制的?”

  他不可置信地?fù)屵^(guò)鼠標(biāo),親自檢索了一遍,同樣無(wú)果。

  “嘿這幫廠家都是飯桶嗎??jī)赡炅硕挤虏怀鲆粋€(gè)專(zhuān)利。地上錢(qián)太多都懶得彎腰撿了是不是?”

  他邊碎碎念邊掏出手機(jī),播出了一個(gè)電話(huà)。

  “歡迎您致電塔喀挼生物技術(shù)有限公司,請(qǐng)問(wèn)有什么可以幫到您的嗎?”

  “啊,我找高經(jīng)理。”

  “好的,請(qǐng)問(wèn)您貴姓?!?p>  “盧?!?p>  “好的,這就幫您轉(zhuǎn)接?!?p>  “盧先生您好,請(qǐng)問(wèn)是又有什么采購(gòu)需求了嗎?”

  “老高啊,我問(wèn)你個(gè)事兒。你們公司能代組鋅指嗎?”

  “抱歉了哈,我們沒(méi)有這個(gè)產(chǎn)品。”

  “那你們同行,或者上游廠家有沒(méi)有啊幫我打聽(tīng)一下?!?p>  “沒(méi)有?!?p>  “怎么這么肯定?”

  “說(shuō)實(shí)話(huà),圣加蒙那專(zhuān)利剛過(guò)期的時(shí)候,我們就想仿了,但是沒(méi)仿出來(lái),就不了了之了?!?p>  “怎么回事?是有什么技術(shù)上的難點(diǎn)嗎?”

  電話(huà)那頭的人忽然壓低了聲音,“我跟你說(shuō)了你可別瞎傳啊。我們研發(fā)部門(mén),一步一步照著專(zhuān)利做,過(guò)程極其順利,可是一測(cè)效率就是百分之零。我們隔壁那幾個(gè)廠也都是這樣。說(shuō)實(shí)話(huà),我們都懷疑他們那專(zhuān)利有問(wèn)題,按理說(shuō)不可能復(fù)現(xiàn)不了的?!?p>  “???”盧赫一時(shí)間消化不了。

  “哎呀,就是這樣。您是我們老客戶(hù)了,才跟您說(shuō)這么多。不過(guò)沒(méi)有鋅指也無(wú)所謂,我們這邊建議您還是用CRISPR吧,又簡(jiǎn)單效率又高。沒(méi)必要去死磕那種20年前的老古董。”

  “好吧,謝了啊老高?!?p>  “不客氣不客氣,有什么需要盡管聯(lián)系我?!?p>  盧哥掛掉電話(huà),扯掉浴巾,又開(kāi)始撓頭,“專(zhuān)利還能有假?真當(dāng)審查員是吃白飯的嗎?”

  “就是!”菜菜也不屑地說(shuō),“三個(gè)堿基對(duì)應(yīng)一個(gè)氨基酸,DNA就只有四種堿基,理論上只有64種氨基酸序列,也就區(qū)區(qū)64種鋅指來(lái)回組合,DNA的GPS不就有了嗎?這有什么難的???”

  盧赫聽(tīng)后不可思議地吸了一口涼氣,搖著頭拉過(guò)一把椅子,示意菜菜坐下。他滿(mǎn)臉慈愛(ài)地看著眼前這個(gè)頭腦和四肢都簡(jiǎn)單只有10根手指頭發(fā)達(dá)的傻姑娘,說(shuō):“來(lái),讓為師考考你,你先說(shuō)說(shuō),什么是鋅指技術(shù)?”

  菜菜一臉你絕對(duì)考不住我地回答道:“首先,根據(jù)‘中心法則’,基因組DNA通過(guò)轉(zhuǎn)錄和翻譯兩個(gè)步驟知道蛋白質(zhì)生產(chǎn)。其中,轉(zhuǎn)錄指基于DNA模板的RNA合成,翻譯指基于RNA模板的蛋白質(zhì)合成,進(jìn)而決定了我們的性狀?!?p>  “你曾經(jīng)的偶像羅伯特·里德還發(fā)現(xiàn),在RNA的合成過(guò)程種,有一種聚合酶起了關(guān)鍵作用。它就像生產(chǎn)流水線上的裝配工人,根據(jù)包工頭DNA提供的圖紙,一個(gè)堿基、一個(gè)堿基地組裝連接成RNA長(zhǎng)鏈?!?p>  “其次,里德還發(fā)現(xiàn),RNA的生產(chǎn)過(guò)程中,除了DNA、RNA聚合酶和堿基原料以外,還存在一個(gè)叫做TFIIIA的轉(zhuǎn)錄因子。它就像一個(gè)指揮官,告訴RNA聚合酶從DNA圖紙的哪里開(kāi)始組裝。這就解釋了為什么所有體細(xì)胞都共享一個(gè)基因組,但血紅蛋白只能在紅細(xì)胞內(nèi)合成,胰島素只能在胰島β細(xì)胞中生產(chǎn)?!?p>  “最后,艾倫·克魯格發(fā)現(xiàn),TFIIIA之所以可以特異性結(jié)合DNA,是因?yàn)樗袀€(gè)DNA識(shí)別模塊。其中數(shù)十個(gè)氨基酸圍繞在游離的鋅離子周邊,形成一個(gè)像手指一樣的立體結(jié)構(gòu),這就是鋅指?!?p>  “很好?!北R赫連連點(diǎn)頭,“然后呢?”

  “然后?然后不就是一個(gè)鋅手指能夠識(shí)別三個(gè)堿基序列,把多個(gè)鋅手指組合在一起,連接上核酸內(nèi)切酶,不就能完成特異性識(shí)別并且咔嚓一下子剪斷DNA了嘛?”

  菜菜說(shuō)完得意地眨著眼睛望著盧赫,好像在說(shuō):快表?yè)P(yáng)我。

  “沒(méi)了?”盧赫追問(wèn)道。

  “沒(méi)啦呀。3個(gè)堿基表征一個(gè)氨基酸,理論上氨基酸也就只有64種,找到對(duì)應(yīng)的64個(gè)鋅手指,排列組合在一起,實(shí)現(xiàn)對(duì)靶標(biāo)基因的精確定位?!?p>  “唉。。?!北R赫嘆氣道,“姑娘你還是太年輕。言之易,行之難。我之前總跟你說(shuō)鋅指組裝起來(lái)很難你知道為什么嗎?”

  “對(duì)呀!為什么呀?按原理來(lái)看,組裝鋅指不就是有手就能干的事嘛?”

  “因?yàn)殇\指之間是會(huì)互相干擾的。比如,你想要組一個(gè)能特異性識(shí)別GGTAAGATC的鋅指。你以為是把GGT、AAG、ATC對(duì)應(yīng)的三個(gè)鋅指粘起來(lái)就行了嗎?不是的。鋅指之間會(huì)互相干擾,GGT的鋅指會(huì)稍微摸到AGG的A一點(diǎn),同樣ATC的鋅指也會(huì)暗戳戳地碰一下AGG的G,反之亦然。這相當(dāng)于有效的識(shí)別序列被模糊成了GGNNANNTC,使特異性結(jié)合的能力大大下降,脫靶能脫到姥姥家去。”

  菜菜聽(tīng)后蹙起眉頭,嘟著嘴默默沉思。

  “不過(guò)克魯格找到了一個(gè)十分‘優(yōu)雅’的方式,解決了這個(gè)問(wèn)題。每一個(gè)3堿基序列都有可能對(duì)應(yīng)多個(gè)鋅手指,早在30年前就積累出大幾百個(gè)了,總能找到兩個(gè)能和諧共處的鋅指。對(duì)于GGTAAGATC來(lái)說(shuō),可以先找到和諧相處的GGT-AAG(A),再找到和諧相處的AAG(B)-ATC,最終再搜尋出一個(gè)AAG(C)使它和AAG(A)、AAG(B)結(jié)構(gòu)類(lèi)似,問(wèn)題就解決了。”

  “通過(guò)6個(gè)人就能認(rèn)識(shí)全世界?”菜菜驚嘆道。

  “沒(méi)錯(cuò),就是這個(gè)道理?!北R赫點(diǎn)頭稱(chēng)贊,“不過(guò),雖然原理簡(jiǎn)單,但做起來(lái)很難。實(shí)際的鋅指組裝是一個(gè)極其困難且復(fù)雜的過(guò)程。我現(xiàn)在讓你立刻要到馬花騰的聯(lián)系方式,并通知他趕緊V我50,你辦得到嗎?”

  菜菜信服地?fù)u了搖頭。

  “所以啊,這就是圣加蒙鋅指專(zhuān)利的核心之處,快速設(shè)計(jì)和組裝鋅指?!?p>  “那你之前為什么總說(shuō)自己用鋅指編輯火焰龜很難,是試了幾千次冒碰出來(lái)的?”菜菜毫不客氣地?fù)糁辛吮R赫的痛處。

  盧赫把浴巾蒙到臉上,含糊不清地說(shuō):“這就是問(wèn)題所在啊。圣加蒙壟斷鋅指技術(shù)這么多年,好不容易專(zhuān)利過(guò)期了,還仿不出來(lái)?,F(xiàn)在想來(lái),雖然我當(dāng)初試了那么多次才成功,但倘若我不用他們的平臺(tái),我跟金哥永遠(yuǎn)都沒(méi)有緣分相見(jiàn)。”

  菜菜眼見(jiàn)著面前這個(gè)好不容易走出陰霾,又重歸垂頭喪氣的人,連忙安慰道:“那我們買(mǎi)一套吧,買(mǎi)一套他們的組裝平臺(tái)?,F(xiàn)在靶標(biāo)基因位點(diǎn)和鋅指數(shù)據(jù)都是現(xiàn)成的,你再組裝一個(gè)編輯出金哥二世不是分分鐘的事嘛?”

  但她沒(méi)想到是,盧赫聽(tīng)后竟更加抓狂了,他把浴巾從臉上拽下一半,憂(yōu)郁地望著菜菜,“首先,他們不賣(mài)了。其次,賣(mài)我我也買(mǎi)不起。最后,我沒(méi)有編輯金哥的鋅指數(shù)據(jù)。當(dāng)初在南州灣里德實(shí)驗(yàn)室用的他們的平臺(tái),是一體化的。你給它DNA序列和靶標(biāo)基因,試劑盒一塞,它直接給你出合成結(jié)果。這是為了保護(hù)他們的商業(yè)機(jī)密?!?p>  盧赫說(shuō)完,兩人同時(shí)陷入了沉默。他們現(xiàn)在的處境完全就是:我有一個(gè)很棒的想法,但我還差一個(gè)程序員。

  盧赫的頭頂冒著蒸蒸的水汽,水汽裊裊上升把頭頂?shù)陌谉霟魰灥靡黄:K瓦@么仰著頭,對(duì)著燈光發(fā)呆。

  忽然,他的腦海中忽然閃過(guò)一瞬他看過(guò)不久的一篇論文。那是一篇用CRISPR技術(shù)編輯模板小鼠的文章,里面的對(duì)照組用的是鋅指,通訊作者的單位是南州灣大學(xué)。當(dāng)初里德實(shí)驗(yàn)室買(mǎi)下鋅指平臺(tái)時(shí)是永久授權(quán),他們現(xiàn)在還在用!

  他心中立刻冒出一個(gè)大膽的想法,“你說(shuō),我回到南州灣大學(xué)借著他們的平臺(tái)去把金哥二世、莉莉白和皮卡丘一起造出來(lái),這怎么樣?”

  菜菜狐疑地瞥了一眼盧赫,好似對(duì)方是一個(gè)異想天開(kāi)的傻子:“您老年紀(jì)太大估計(jì)都已經(jīng)忘了,里德那棟樓里可是有個(gè)三級(jí)實(shí)驗(yàn)室,進(jìn)樓需要一道安檢、一道刷卡閘機(jī)和一道人臉識(shí)別。請(qǐng)問(wèn)您是打算偷摸溜進(jìn)去還是硬闖呀?”

  盧赫笑著搖頭,“都不是,我是五好青年,我打算正大光明地進(jìn)去?!?p>  “那要怎么進(jìn)去呀?”

  “考進(jìn)去!”

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