南書房
1677年，康熙帝設(shè)立南書房，起初是為了與翰林院詞臣們研討學(xué)問，吟詩作畫而設(shè)。由于南書房“非崇班貴檁、上所親信者不得入”，所以它完全是由皇帝嚴(yán)密控制的一個核心機要機構(gòu)，隨時承旨出詔行令，這使南書房“權(quán)勢日崇”。南書房地位的提高，是康熙帝削弱議政王大臣會議權(quán)力，同時將外朝內(nèi)閣的某些職能移歸內(nèi)廷，實施高度集權(quán)的重要步驟。
軍機處
1729年，清軍在西北與準(zhǔn)噶爾蒙古激戰(zhàn)，為及時處理軍報雍正帝始設(shè)軍機房，雍正十年改稱軍機處。乾隆帝即位后安排數(shù)位“總理事務(wù)王大臣”進入軍機處，故改名總理事務(wù)處。1737年，乾隆服滿親政，總理事務(wù)王大臣等自請罷職，恢復(fù)軍機處名稱，自此遂成定制，軍機處成為直接對皇帝負(fù)責(zé)的核心權(quán)力機構(gòu)，滿洲議政王大臣會議的地位更被削弱至幾乎可忽略不計，政治權(quán)力全部掌握在皇帝手中，成為清代中央集權(quán)制度的頂峰。直至1911年四月初十清廷宣布成立“責(zé)任內(nèi)閣”，軍機處廢止
軍機處外景
清朝責(zé)任內(nèi)閣
宣統(tǒng)三年四月初十（1911年5月18日），清政府宣布廢除軍機處，實行內(nèi)閣制，任命內(nèi)閣總理大臣和諸大臣組成內(nèi)閣。由慶親王愛新覺羅·奕劻組成中國歷史上第一個現(xiàn)代意義上的內(nèi)閣。然而，由于內(nèi)閣成員中過半數(shù)為皇族或滿人，又被稱為“皇族內(nèi)閣”。該內(nèi)閣在辛亥革命后倒臺，由袁世凱組成的新內(nèi)閣所取代。
執(zhí)行機關(guān)
六部（吏、戶、禮、兵、刑、工）為清朝最高執(zhí)行機關(guān)，各部長官稱尚書，副長官稱侍郎，以前尚書均由滿人擔(dān)任。1644年規(guī)定尚書及侍郎滿、漢各一。
清朝前期重要官員
在六部之外和六部并立的中央行政機構(gòu)有：大理寺、太常寺、光祿寺、太仆寺、鴻臚寺、國子監(jiān)、欽天監(jiān)、翰林院、太醫(yī)院、理藩院、宗人府、詹事府、內(nèi)務(wù)府、都察院。清朝官員等級分“九品十八級”，每等有正從之別，不在十八級以內(nèi)的叫做未入流，在級別上附于從九品。
刑律
1647年，《大清律例》編修完成?！洞笄迓伞坊旧铣幸u《明律》的內(nèi)容。后經(jīng)康熙、雍正兩朝屢次增刪，并于雍正五年公布。但清朝最經(jīng)常起作用的是例，而不是律。胥吏都諳熟例案，?？蓤?zhí)例以壓制長官。清廷對各少數(shù)民族地區(qū)還有各種特訂的法律，如蒙古族有“蒙古律例”，維吾爾族有“回律”，藏族有“番律”等等，以加強對各少數(shù)民族人民的統(tǒng)治。
光緒三十三年修訂法律館“專以模范列強”為宗旨，制定大清新刑律草案。草案分總則、分則兩編，主刑、從刑兩類；并制定了有關(guān)國交、選舉、交通、通訊等方面的犯罪條款，確立了緩刑、假釋的制度。在新刑律頒行前，修訂法律館刪修大清律例，以《大清現(xiàn)行刑律》作為過渡，于1910年頒行。
軍事
八旗
清前期清軍主要分為八旗和綠營二種。八旗制是努爾哈赤在女真牛錄制的基礎(chǔ)上創(chuàng)立的一種兵民合一的制度。八旗又分為滿洲八旗、蒙古八旗、漢軍八旗。旗設(shè)都統(tǒng)（固山額真），由中央八樸詡統(tǒng)衙門掌握，地方督撫無權(quán)征調(diào)。1650年，順治帝對八旗制度進行改革，由自己親自掌握正黃、鑲黃、正白三旗，形成了“上三旗”和“下五旗”，改變了以前八旗由不同王公掌握的局面，同時加強上三旗的實力，滿洲議政王大臣會議的權(quán)力有所削弱。
八旗軍旗
綠營和團練
綠營兵，主要是清兵入關(guān)后收編的明朝降軍和各省改編的隊伍，用綠色軍旗，故稱綠旗兵或綠營兵。兵種有馬兵、步兵和水師。在各省者，由總督、巡撫、提督、總兵等所統(tǒng)轄。
清中葉以后，又有漢族地主自募自練的團練鄉(xiāng)勇。后因太平天國運動興起，由于八旗長期由政府供養(yǎng)，游手好閑，不習(xí)武事，逐漸喪失了戰(zhàn)斗力，在鎮(zhèn)壓太平軍時屢敗，于是各地地主團練武裝迅速發(fā)展，曾國藩的湘軍便應(yīng)運而生。還有李鴻章組織的淮軍，左宗棠的楚軍等，這些地主團練武裝后改編為練軍與防軍。